Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tsc22d3Q9Z2S7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms