Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms