Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt16Q9Z2K1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms