Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 555.4 ms