Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clcn5Q9WVD4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms