Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trpc2Q9R244 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpc2Q9R244 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms