Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms