Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NrkQ9R0G8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NrkQ9R0G8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NrkQ9R0G8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NrkQ9R0G8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NrkQ9R0G8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrkQ9R0G8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrkQ9R0G8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrkQ9R0G8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrkQ9R0G8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NrkQ9R0G8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms