Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod1Q9R0E2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms