Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms