Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms