Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ChmlQ9QZD5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChmlQ9QZD5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms