Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubxn8Q9QZ49 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms