Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phtf1Q9QZ09 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms