Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd4Q9QY39 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms