Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms