Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms