Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms