Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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