Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Chrac1Q9JKP8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Chrac1Q9JKP8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Chrac1Q9JKP8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrac1Q9JKP8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Chrac1Q9JKP8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Chrac1Q9JKP8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Chrac1Q9JKP8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Chrac1Q9JKP8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Chrac1Q9JKP8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Chrac1Q9JKP8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrac1Q9JKP8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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