Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
AtrQ9JKK8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms