Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnga3Q9JJZ8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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