Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caln1Q9JJG7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms