Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Efcc1Q9JJF6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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Efcc1Q9JJF6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Efcc1Q9JJF6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Efcc1Q9JJF6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Efcc1Q9JJF6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Efcc1Q9JJF6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Efcc1Q9JJF6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Efcc1Q9JJF6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efcc1Q9JJF6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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