Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms