Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms