Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tcirg1Q9JHF5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms