Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Tm9sf3Q9ET30 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tm9sf3Q9ET30 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tm9sf3Q9ET30 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tm9sf3Q9ET30 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tm9sf3Q9ET30 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tm9sf3Q9ET30 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tm9sf3Q9ET30 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tm9sf3Q9ET30 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tm9sf3Q9ET30 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tm9sf3Q9ET30 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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