Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Usp29Q9ES63 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp29Q9ES63 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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