Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfip11Q9ERA6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfip11Q9ERA6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms