Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms