Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsc1Q9EP53 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsc1Q9EP53 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsc1Q9EP53 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsc1Q9EP53 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsc1Q9EP53 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsc1Q9EP53 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms