Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syde1Q9DBZ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms