Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg8Q9DBM0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg8Q9DBM0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg8Q9DBM0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg8Q9DBM0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg8Q9DBM0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg8Q9DBM0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg8Q9DBM0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg8Q9DBM0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg8Q9DBM0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms