Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp2aQ9DB34 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms