Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms