Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms