Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms