Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Actrt2Q9D9L5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt2Q9D9L5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms