Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D8Q6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Q9D8Q6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Q9D8Q6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Q9D8Q6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Q9D8Q6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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