Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl4Q9D8E6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms