Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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