Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Capns2Q9D7J7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capns2Q9D7J7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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