Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms