Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rtl8cQ9D6I0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rtl8cQ9D6I0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rtl8cQ9D6I0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl8cQ9D6I0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rtl8cQ9D6I0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rtl8cQ9D6I0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rtl8cQ9D6I0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rtl8cQ9D6I0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl8cQ9D6I0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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