Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab11fip1Q9D620 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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