Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zc2hc1bQ9D534 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms