Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam227bQ9D518 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms