Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930564D02RikQ9D4S4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930564D02RikQ9D4S4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms