Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf6Q9D4J7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms